题主给的问题描述太过简短，那么答主只能根据自己理解的方向来说说可能出现错误的原因：
一般情况下Java连接数据库用的都是jdbc，不知道题主的用最基本的jdbc去写的连接access还是使用框架去配置连接的。
使用框架做配置连接
题主也提到了查询能正常查询，那就证明配置信息内容是完全没有问题的，能够正常使用。那这样的话有可能你做增，删，改的的时候对应的数据本来是没有删除，你的判断写的有问题导致，但是这个可能性应该不大。那就可能是sql语句的问题了，下面在详细的说话sql语句的问题。
使用最原始的jdbc操作
能在增删改上面成功，没有报错那证明你的代码敲的是对的，但是你的对应的引用相互调用多次，可能导致错误，打个比喻：Connection conn=new Connection(连接数据库的字符串);
Statement sta=conn.createStatement();
String sql="添加sql语句";
int count=sta.excute(sql);
然后在下面你可能在次用到Statement对象：
String sql="删除sql语句";
int count=sta.excute(sql);
这个时候你多次使用同一个Statement对象很大可能会出现异常
在可能是你操作的数据库和你查看的数据库不是同一个，刚好都用同样的表格：
比如：
Connection conn = DriverManager.getConnection("jdbc:mysql://127.0.0.1:3306/exam?characterEncoding=UTF-8","root", "admin");
你现在操作的是exam数据库里面的表格，但是你现在查看的却是其它数据库；这个可能性也有但是估计也不大。
jdbc和比较传统的hibernate
如果你是用框架是做的那很大的可能是你配置的sql语句做的是无用操作，什么是无用操作呢？现在数据库里面已经没有了学号为1的学生，但是你还删除这条数据，数据库肯定没有反应。不排除有这种可能但是几率比较小。也有可能你传递过来的删除，修改的条件的条件数据，出现问题也有可能导致删除或者修改失败。
如果你是用jdbc去做的，那很有可能sql语句编写有问题，因为sql语句的字符串拼接其中有很多“ ”和‘ ’的拼接：
比如上图看到的，ssex这个字段在数据库中是一个字符类型，所以在sql语句中需要用‘ ’括起来，这里还要拼一个获取过来的条件。所以‘ ’和“ ”之间的拼接真的很容易出问题。
代码代码，坐等代码
总结：出错的具体原因，真的是需要查看代码才能具体解决，这里能给出来的提示也很有限。以上的出错的原因也是答主自己能给出的几个，希望能帮到题主。
如果有小伙伴有其它的提示，请在评论区留言，或者点个关注我们一起探讨探讨。
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这个问题的原因可能不止一个，看到同行回答的也都有道理，但有道理的不一定能解决这个问题，我从实际的应用情况，说明一下碰到的这个问题，或许也是一种启发。
Access数据库也称为桌面型的数据库，是Microsoft Office的一个组件，全称为Microsoft Office Access，这个数据库建立比较简单，建数据表时对主键没有特殊的要求，对于没有建主键的数据表，当你在用Access所带的VBA语言进行开发时，使用SQL语言进行相关的操作是没有问题的。
但是，当你用其他语言连接到Access数据库时，一定要注意，有些语言一定要在有主键的情况下才能进行SQL语句操作，不然就有可能表面操作成功，而实际上没有任何改变。
对于JAVA我不太熟悉，只此是一点开发过程中的经验而已，仅作参考。
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