Kubernetes 亲和性调度

摘要：换句话说，亲和性选择节点仅在调度时起作用。先创建集群反亲和性打散各个副本再部署服务，需要打散并且与服务共存，配置如下注意需要进行大量处理，所以会明显减慢大型集群的调度时间，不建议在大于几百个节点的集群中使用该功能。

前一篇文章 Kubernetes 调度器浅析，大致讲述了调度器的工作原理及相关调度策略。这一章会继续深入调度器，介绍下“亲和性调度”。

Kubernetes 支持限制 Pod 在指定的 Node 上运行，或者指定更倾向于在某些特定 Node 上运行。
有几种方式可以实现这个功能：

NodeName: 最简单的节点选择方式，直接指定节点，跳过调度器。

NodeSelector: 早期的简单控制方式，直接通过键—值对将 Pod 调度到具有特定 label 的 Node 上。

NodeAffinity: NodeSelector 的升级版，支持更丰富的配置规则，使用更灵活。(NodeSelector 将被淘汰.)

PodAffinity: 根据已在节点上运行的 Pod 标签来约束 Pod 可以调度到哪些节点，而不是根据 node label。

nodeName 是 PodSpec 的一个字段，用于直接指定调度节点，并运行该 pod。调度器在工作时，实际选择的是 nodeName 为空的 pod 并进行调度然后再回填该 nodeName，所以直接指定 nodeName 实际是直接跳过了调度器。换句话说，指定 nodeName 的方式是优于其他节点选择方法。

方法很简单，直接来个官方示例：

apiVersion: v1
kind: Pod
metadata:
  name: nginx
spec:
  containers:
  - name: nginx
    image: nginx
  nodeName: kube-01

当然如果选择的节点不存在，或者资源不足，那该 pod 必然就会运行失败。

nodeSelector 也是 PodSpec 中的一个字段，指定键—值对的映射。
如果想要将 pod 运行到对应的 node 上，需要先给这些 node 打上 label，然后在 podSpec.NodeSelector 指定对应 node labels 即可。

步骤如下：

设置标签到 node 上：

kubectl label nodes kubernetes-node type=gpu

pod 配置添加 nodeSelector 字段：

apiVersion: v1
kind: Pod
metadata:
  name: nginx
spec:
  containers:
  - name: nginx
    image: nginx
  nodeSelector:
    type: gpu

Kubernetes 内置了一些节点标签：

kubernetes.io/hostname

beta.kubernetes.io/instance-type

beta.kubernetes.io/os

beta.kubernetes.io/arch

failure-domain.beta.kubernetes.io/zone

failure-domain.beta.kubernetes.io/region

有些标签是对云提供商使用。

还有些表示 node role 的 labels（可以指定 master、lb 等）:

kubernetes.io/role

node-role.kubernetes.io

nodeSelector 通过 k-v 的方式非常简单的支持了 pod 调度限制到具有特定标签的节点上。而 nodeAffinity 根据亲和力 & 反亲和力极大地扩展了能够表达的约束信息。

nodeAffinity 特性的设计初衷就是为了替代 nodeSelector。

nodeAffinity 当前支持的匹配符号包括：In、NotIn、Exists、DoesNotExists、Gt、Lt 。

nodeAffinity 当前支持两种调度模式:

requiredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution: 一定要满足的条件，如果没有找到满足条件的节点，则 Pod 创建失败。所有也称为hard 模式。

preferredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution: 优先选择满足条件的节点，如果没有找到满足条件的节点，则在其他节点中择优创建 Pod。所有也称为 soft 模式。

两种模式的名字特长，这是 k8s 的命名风格。其中IgnoredDuringExecution的意义就跟 nodeSelector 的实现一样，即使 node label 发生变更，也不会影响之前已经部署且又不满足 affinity rules 的 pods，这些 pods 还会继续在该 node 上运行。换句话说，亲和性选择节点仅在调度 Pod 时起作用。

k8s 社区正在计划提供 requiredDuringSchedulingRequiredDuringExecution  模式，便于驱逐 node 上不满足 affinity rules 的 pods。

来个官方示例，看下怎么玩:

apiVersion: v1
kind: Pod
metadata:
  name: with-node-affinity
spec:
  affinity:
    nodeAffinity:
      # 必须选择 node label key 为 kubernetes.io/e2e-az-name,
      # value 为 e2e-az1 或 e2e-az2.
      requiredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution:
        nodeSelectorTerms:
        - matchExpressions:
          - key: kubernetes.io/e2e-az-name
            operator: In
            values:
            - e2e-az1
            - e2e-az2
      # 过滤掉上面的必选项后，再优先选择 node label key 为 another-node-label-key
      # value 为 another-node-label-value.
      preferredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution:
      # 如果满足节点亲和，积分加权重(优选算法，会对 nodes 打分)
      # weight: 0 - 100
      - weight: 1
        preference:
          matchExpressions:
          - key: another-node-label-key
            operator: In
            values:
            - another-node-label-value
  containers:
  - name: with-node-affinity
    image: k8s.gcr.io/pause:2.0

简单看下 NodeAffinity 的结构体，下面介绍注意事项时会涉及：

type NodeAffinity struct {
    RequiredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution *NodeSelector
    PreferredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution []PreferredSchedulingTerm
}

type NodeSelector struct {
    NodeSelectorTerms []NodeSelectorTerm
}

type NodeSelectorTerm struct {
    MatchExpressions []NodeSelectorRequirement
    MatchFields []NodeSelectorRequirement
}

配置相关的注意点：

如果 nodeSelector 和 nodeAffinity 两者都指定，那 node 需要两个条件都满足，pod 才能调度。

如果指定了多个 NodeSelectorTerms，那 node 只要满足其中一个条件，pod 就可以进行调度。

如果指定了多个 MatchExpressions，那必须要满足所有条件，才能将 pod 调度到该 node。

nodeSelector & nodeAffinity 都是基于 node label 进行调度。而有时候我们希望调度的时候能考虑 pod 之间的关系，而不只是 pod 和 node 的关系。

举个例子，会有需求希望服务 A 和 B 部署在同一个机房、机架或机器上，因为这些服务可能会对网路延迟比较敏感，需要低延时；再比如，希望服务 C 和 D 又希望尽量分开部署，即使一台主机甚至一个机房出了问题，也不会导致两个服务一起挂而影响服务可用性，提升故障容灾的能力。

podAffinity 会基于节点上已经运行的 pod label 来约束新 pod 的调度。
其规则就是“如果 X 已经运行了一个或者多个符合规则 Y 的 Pod，那么这个 Pod 应该（如果是反亲和性，则是不应该）调度到 X 上”。
这里的 Y 是关联 namespace 的 labelSelector，当然 namespace 也可以是 all。和 node 不同，pod 是隶属于 namespace 下的资源，所以基于 pod labelSelector 必须指定具体的 namespace；而 X 则可以理解为一个拓扑域，类似于 node、rack、zone、cloud region 等等，就是前面提到的 内置 Node 标签 ，当然也可以自定义。

看下 pod affinity 涉及的结构体，便于进行功能介绍：

type Affinity struct {
    // NodeAffinity 前面介绍了
    NodeAffinity *NodeAffinity
    // pod 亲和性
    PodAffinity *PodAffinity
    // pod 反亲和性
    PodAntiAffinity *PodAntiAffinity
}

type PodAffinity struct {
    // hard 模式, 必选项
    RequiredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution []PodAffinityTerm
    // soft 模式, 进行 node 优先
    PreferredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution []WeightedPodAffinityTerm
}

type PodAffinityTerm struct {
    LabelSelector *metav1.LabelSelector
    Namespaces []string
    TopologyKey string
}

type WeightedPodAffinityTerm struct {
    Weight int32
    PodAffinityTerm PodAffinityTerm
}

podAffinity 和 nodeAffinity 有相似的地方，使用了 labelSelector 进行匹配，支持的匹配符号包括：In、NotIn、Exists、DoesNotExists；
也支持两种调度模式 requiredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution 和 preferredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution, 功能和 nodeAffinity 一样，这里就不在累述。

podAffinity 和 nodeAffinity 也有较大的差异，前面讲了 pod 是 namespace 资源，所以必然会需要配置 namespaces，支持配置多个 namespace。如果省略的话，默认为待调度 pod 所属的 namespace；如果定义了但是值为空，则表示使用 “all” namespaces。

还有一个较大的差别 TopologyKey, 便于理解进行多带带介绍。

TopologyKey 用于定义 in the same place，前面也介绍了是拓扑域的概念。

看下面的图，这两个 pod 到底该如何算在一个拓扑域？

如果我们使用k8s.io/hostname，in the same place 则意味着在同一个 node，那下图的 pods 就不在一个 place：

如果我们使用failure-domain.k8s.io/zone 来表示一个 place，那下图的 pods 就表示在一个 zone:

当然我们也可以自定义 node labels 作为 TopologyKey。比如我们可以给一组 node 打上 rack 标签，那下图的 pods 表示在同一个 place:

原则上，topologyKey 可以是任何合法的 label key。但是出于性能和安全考虑，topologyKey 存在一些限制：

对于亲和性和反亲和性的 requiredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution 模式，topologyKey 不能为空

pod 反亲和性 requiredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution 模式下，LimitPodHardAntiAffinityTopology 权限控制器会限制 topologyKey 只能设置为 kubernetes.io/hostname。当然如果你想要使用自定义 topology，那可以简单禁用即可。

pod 反亲和性 preferredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution 模式下，topologyKey 为空则表示所有的拓扑域。截止 v1.12 版本，所有的拓扑域还只能是 kubernetes.io/hostname, failure-domain.beta.kubernetes.io/zone 和 failure-domain.beta.kubernetes.io/region 的组合。

除此之外，topologyKey 可以是任何合法的 label key。

来个官方示例，有三节点集群，需要分别部署 3 份 web 和 redis 服务。希望 web 与 redis 服务共存，但需要保证各个服务的副本分散部署。
先创建 redis 集群：

apiVersion: apps/v1
kind: Deployment
metadata:
  name: redis-cache
spec:
  selector:
    matchLabels:
      app: store
  replicas: 3
  template:
    metadata:
      labels:
        app: store
    spec:
      affinity:
        // pod 反亲和性, 打散 redis 各个副本
        podAntiAffinity:
          requiredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution:
          - labelSelector:
              matchExpressions:
              - key: app
                operator: In
                values:
                - store
            topologyKey: "kubernetes.io/hostname"
      containers:
      - name: redis-server
        image: redis:3.2-alpine

再部署 web 服务，需要打散并且与 redis 服务共存，配置如下：

apiVersion: apps/v1
kind: Deployment
metadata:
  name: web-server
spec:
  selector:
    matchLabels:
      app: web-store
  replicas: 3
  template:
    metadata:
      labels:
        app: web-store
    spec:
      affinity:
        podAntiAffinity:
          requiredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution:
          - labelSelector:
              matchExpressions:
              - key: app
                operator: In
                values:
                - web-store
            topologyKey: "kubernetes.io/hostname"
        podAffinity:
          requiredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution:
          - labelSelector:
              matchExpressions:
              - key: app
                operator: In
                values:
                - store
            topologyKey: "kubernetes.io/hostname"
      containers:
      - name: web-app
        image: nginx:1.12-alpine

注意1: pod affinity 需要进行大量处理，所以会明显减慢大型集群的调度时间，不建议在大于几百个节点的集群中使用该功能。
注意2: pod antiAffinity 要求对节点进行一致标志，即集群中的所有节点都必须具有适当的标签用于配置给 topologyKey，如果节点缺少指定的 topologyKey 指定的标签，则可能会导致意外行为。

Assigning Pods to Nodes - Kubernetes

node affinity

pod affinity

性能优化: Improve performance of affinity/anti-affinity predicate by 20x in large clusters by bsalamat

K8S 的调度 (一) 抽象优雅的 Affinity

Scheduling in Kubernetes, Part 2: Pod Affinity – Koki – Medium