让代码飞起来——高性能Julia学习笔记（三）

edgardeng 发布于2019-06-26 18:42 / 1413人阅读

摘要：前面两篇让代码飞起来高性能学习笔记一让代码飞起来高性能学习笔记二，介绍了如何写出高性能的代码，这篇结合我最近的项目，简单测试对比一下各种语言用算法计算的效率。下一篇，我们就来看一下中如何利用并行进一步提高效率。

前面两篇让代码飞起来——高性能 Julia 学习笔记（一）让代码飞起来——高性能 Julia 学习笔记（二），介绍了如何写出高性能的 Julia 代码，这篇结合我最近的项目，简单测试对比一下各种语言用 monte carlo 算法计算 pi 的效率。

首先声明一下，本文不能算严格意义上的性能测试，也不想挑起语言圣战，个人能力有限，实现的不同语言版本代码也未必是最高效的，基本都是 naive 实现。

如果对 Monte Carlo 算法不熟悉，可以参考下面两个资料，我就不浪费时间重复了：

https://zh.wikipedia.org/wiki...

http://www.ruanyifeng.com/blo...

机器是 2015 年的 MacPro：

Processor: 2.5GHz Intel Core i7
Memory: 16GB 1600 MHZ DDR3
Os: macOS High Sierra Version 10.13.4

JS 版本

function pi(n) {
  let inCircle = 0;
  for (let i = 0; i <= n; i++) {
    x = Math.random();
    y = Math.random();
    if (x * x + y * y < 1.0) {
      inCircle += 1;
    }
  }
  return (4.0 * inCircle) / n;
}
const N = 100000000;
console.log(pi(N));

结果：

➜  me.magicly.performance git:(master) ✗ node --version
v10.11.0
➜  me.magicly.performance git:(master) ✗ time node mc.js
3.14174988
node mc.js  10.92s user 0.99s system 167% cpu 7.091 total

Go 版本

package main

import (
    "math/rand"
)

func PI(samples int) (result float64) {
    inCircle := 0
    r := rand.New(rand.NewSource(42))

    for i := 0; i < samples; i++ {
        x := r.Float64()
        y := r.Float64()
        if (x*x + y*y) < 1 {
            inCircle++
        }
    }

    return float64(inCircle) / float64(samples) * 4.0
}

func main() {
    samples := 100000000
    PI(samples)
}

结果：

➜  me.magicly.performance git:(master) ✗ go version
go version go1.11 darwin/amd64
➜  me.magicly.performance git:(master) ✗ time go run monte_carlo.go
go run monte_carlo.go  2.17s user 0.10s system 101% cpu 2.231 total

C 版本

#include 
#include 
#include 
#include 
#define SEED 42

int main(int argc, char **argv)
{
  int niter = 100000000;
  double x, y;
  int i, count = 0;
  double z;
  double pi;

  srand(SEED);
  count = 0;
  for (i = 0; i < niter; i++)
  {
    x = (double)rand() / RAND_MAX;
    y = (double)rand() / RAND_MAX;
    z = x * x + y * y;
    if (z <= 1)
      count++;
  }
  pi = (double)count / niter * 4;
  printf("# of trials= %d , estimate of pi is %g 
", niter, pi);
}

结果：

➜  me.magicly.performance git:(master) ✗ gcc --version
Configured with: --prefix=/Applications/Xcode.app/Contents/Developer/usr --with-gxx-include-dir=/usr/include/c++/4.2.1
Apple LLVM version 9.1.0 (clang-902.0.39.2)
Target: x86_64-apple-darwin17.5.0
Thread model: posix
InstalledDir: /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Toolchains/XcodeDefault.xctoolchain/usr/bin
➜  me.magicly.performance git:(master) ✗ gcc -O2 -o mc-pi-c mc-pi.c
➜  me.magicly.performance git:(master) ✗ time ./mc-pi-c
# of trials= 100000000 , estimate of pi is 3.14155
./mc-pi-c  1.22s user 0.00s system 99% cpu 1.226 total

C++ 版本

#include 
#include  //defines rand(), srand(), RAND_MAX
#include    //defines math functions

using namespace std;

int main()
{
  const int SEED = 42;
  int interval, i;
  double x, y, z, pi;
  int inCircle = 0;

  srand(SEED);

  const int N = 100000000;
  for (i = 0; i < N; i++)
  {
    x = (double)rand() / RAND_MAX;
    y = (double)rand() / RAND_MAX;

    z = x * x + y * y;
    if (z < 1)
    {
      inCircle++;
    }
  }
  pi = double(4 * inCircle) / N;

  cout << "
Final Estimation of Pi = " << pi << endl;
  return 0;
}

结果：

➜  me.magicly.performance git:(master) ✗ c++ --version
Apple LLVM version 9.1.0 (clang-902.0.39.2)
Target: x86_64-apple-darwin17.5.0
Thread model: posix
InstalledDir: /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Toolchains/XcodeDefault.xctoolchain/usr/bin
➜  me.magicly.performance git:(master) ✗ c++ -O2 -o mc-pi-cpp mc-pi.cpp
➜  me.magicly.performance git:(master) ✗ time ./mc-pi-cpp

Final Estimation of Pi = 3.14155
./mc-pi-cpp  1.23s user 0.01s system 99% cpu 1.239 total

Julia 版本

function pi(N::Int)
  inCircle = 0
  for i = 1:N
      x = rand() * 2 - 1
      y = rand() * 2 - 1

      r2 = x*x + y*y
      if r2 < 1.0
          inCircle += 1
      end
  end

  return inCircle / N * 4.0
end

N = 100_000_000
println(pi(N))

结果：

➜  me.magicly.performance git:(master) ✗ julia
               _
   _       _ _(_)_     |  Documentation: https://docs.julialang.org
  (_)     | (_) (_)    |
   _ _   _| |_  __ _   |  Type "?" for help, "]?" for Pkg help.
  | | | | | | |/ _` |  |
  | | |_| | | | (_| |  |  Version 1.0.1 (2018-09-29)
 _/ |\__"_|_|_|\__"_|  |  Official https://julialang.org/ release
|__/                   |

julia> versioninfo()
Julia Version 1.0.1
Commit 0d713926f8 (2018-09-29 19:05 UTC)
Platform Info:
  OS: macOS (x86_64-apple-darwin14.5.0)
  CPU: Intel(R) Core(TM) i7-4870HQ CPU @ 2.50GHz
  WORD_SIZE: 64
  LIBM: libopenlibm
  LLVM: libLLVM-6.0.0 (ORCJIT, haswell)

➜  me.magicly.performance git:(master) ✗ time julia mc.jl
3.14179496
julia mc.jl  0.85s user 0.17s system 144% cpu 0.705 total

另外 Rust 开发环境升级搞出了点问题，没弄好，不过根据之前的经验，我估计跟 C++差不多。

github 上找到一份对比，包含了更多的语言，有兴趣的可以参考一下https://gist.github.com/jmoir... ， LuaJIT 居然跟 Rust 差不多一样快，跟 Julia 官网的 benchmark 比较一致https://julialang.org/benchma... 。

另外实现了两个 Go 的并发版本：

package main

import (
    "fmt"
    "math/rand"
    "runtime"
    "time"
)

type Job struct {
    n int
}

var threads = runtime.NumCPU()
var rands = make([]*rand.Rand, 0, threads)

func init() {
    fmt.Printf("cpus: %d
", threads)
    runtime.GOMAXPROCS(threads)

    for i := 0; i < threads; i++ {
        rands = append(rands, rand.New(rand.NewSource(time.Now().UnixNano())))
    }
}

func MultiPI2(samples int) float64 {
    t1 := time.Now()

    threadSamples := samples / threads

    jobs := make(chan Job, 100)
    results := make(chan int, 100)

    for w := 0; w < threads; w++ {
        go worker2(w, jobs, results, threadSamples)
    }

    go func() {
        for i := 0; i < threads; i++ {
            jobs <- Job{
                n: i,
            }
        }
        close(jobs)
    }()

    var total int
    for i := 0; i < threads; i++ {
        total += <-results
    }

    result := float64(total) / float64(samples) * 4
    fmt.Printf("MultiPI2: %d times, value: %f, cost: %s
", samples, result, time.Since(t1))
    return result
}
func worker2(id int, jobs <-chan Job, results chan<- int, threadSamples int) {
    for range jobs {
        // fmt.Printf("worker id: %d, job: %v, remain jobs: %d
", id, job, len(jobs))
        var inside int
        // r := rand.New(rand.NewSource(time.Now().UnixNano()))
        r := rands[id]
        for i := 0; i < threadSamples; i++ {
            x, y := r.Float64(), r.Float64()

            if x*x+y*y <= 1 {
                inside++
            }
        }
        results <- inside
    }
}

func MultiPI(samples int) float64 {
    t1 := time.Now()

    threadSamples := samples / threads
    results := make(chan int, threads)

    for j := 0; j < threads; j++ {
        go func() {
            var inside int
            r := rand.New(rand.NewSource(time.Now().UnixNano()))
            for i := 0; i < threadSamples; i++ {
                x, y := r.Float64(), r.Float64()

                if x*x+y*y <= 1 {
                    inside++
                }
            }
            results <- inside
        }()
    }

    var total int
    for i := 0; i < threads; i++ {
        total += <-results
    }

    result := float64(total) / float64(samples) * 4
    fmt.Printf("MultiPI: %d times, value: %f, cost: %s
", samples, result, time.Since(t1))
    return result
}

func PI(samples int) (result float64) {
    t1 := time.Now()
    var inside int = 0
    r := rand.New(rand.NewSource(time.Now().UnixNano()))

    for i := 0; i < samples; i++ {
        x := r.Float64()
        y := r.Float64()
        if (x*x + y*y) < 1 {
            inside++
        }
    }

    ratio := float64(inside) / float64(samples)

    result = ratio * 4

    fmt.Printf("PI: %d times, value: %f, cost: %s
", samples, result, time.Since(t1))

    return
}

func main() {
    samples := 100000000
    PI(samples)
    MultiPI(samples)
    MultiPI2(samples)
}

结果：

➜  me.magicly.performance git:(master) ✗ time go run monte_carlo.1.go
cpus: 8
PI: 100000000 times, value: 3.141778, cost: 2.098006252s
MultiPI: 100000000 times, value: 3.141721, cost: 513.008435ms
MultiPI2: 100000000 times, value: 3.141272, cost: 485.336029ms
go run monte_carlo.1.go  9.41s user 0.18s system 285% cpu 3.357 total

可以看出，效率提升了 4 倍。为什么明明有8 个 CPU，只提升了 4 倍呢？其实我的 macpro 就是 4 核的， 8 是超线程出来的虚拟核，在 cpu 密集计算上并不能额外提升效率。可以参考这篇文章：物理 CPU、CPU 核数、逻辑 CPU、超线程。

下一篇，我们就来看一下 Julia 中如何利用并行进一步提高效率。

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