在R中连接Oracle数据库

摘要：而使用连接数据库的需求实际是个同事打算使用语言对数据库直接进行操作而不需要每次都导出数据再进行操作。而在中要实现与数据库的操作主要有个包可以使用惹的祸而最开始他选择的是主要是因为在下进行操作。

原文地址:

http://blog.52sox.com/use-r-c...

实际上学习R语言,主要是为了研究时间序列,相比Python的pandas,R中的包要强悍很多。
而使用R连接Oracle数据库的需求,实际是1个同事打算使用R语言对数据库直接进行操作,而不需要每次都导出数据再进行操作。而实际上我们公司是使用Python进行数据分析的。
而在R中,要实现与Oracle数据库的操作,主要有3个包可以使用:

RODBC

RJDBC

ROracle

而最开始他选择的是RODBC,主要是因为在Windows下进行操作。结果卡在了如下的异常中:

1: In odbcDriverConnect("DSN=group;UID=fwy;PWD=fwy") :
  [RODBC] ERROR: state IM014, code 0, message [Microsoft][ODBC 驱动程序管理器] 未发现数据源名称并且未指定默认驱动程序
2: In odbcDriverConnect("DSN=group;UID=fwy;PWD=fwy") :
  ODBC connection failed

可以很明显的看到,是没有安装对应的ODBC驱动。于是从oracle的官方页面下载了如下2个文件:

instantclient-basic-windows.x64

instantclient-odbc-windows.x64

这里我在Windows7上使用的版本是11.2.0.3。将上述2个文件解压后合并在1个文件夹后,通过管理员身份运行文件夹下的odbc_install.exe文件即可安装。
之后通过控制面板->管理工具->数据源(ODBC)中的相关设置即可成功连接。结果在他的Windows10系统中上述操作无法设置成功。
其配置页面类似如下:

ODBC设置成功后就可以通过如下的方式操作Oracle数据库了:

library("RODBC")
db <- odbcConnect(dsn="mesprd", uid="mesprd", pwd="wip24ux")
data <- sqlQuery(db, "SELECT SYSDATE from DUAL")

需要注意的是,在这里第1个参数dsn是我们设置ODBC时对应的名称,如果使用IP地址的方式是无法连接成功的,这是需要注意的。

既然RODBC行不通,那么我们就来实践下RJDBC吧,结果把我搞晕了,实在太复杂了,超出了我头脑的容纳范围。没办法,只能再换种方式了,于是只能试下ROracle了。
我进行了如下的操作:

install.packages("ROracle")

如果直接安装会出现类似如下的页面:

结果安装的过程中提醒我没有找到OCI的库。那么需要安装如下3个包:

instantclient-basic-windows.x64

instantclient-sqlplus-windows.x64

instantclient-sdk-windows.x64

在这里,我使用的版本还是上面的11.2.0.3。安装完成后,还需要设置OCI_LIB64环境变量,以便可以找到对应的文件。
需要注意的是,ROracle的安装在Linux上相对更为简单,在Windows上我们需要手动进行源码的安装。很不幸运的是,其版本1.3.1在Windows7系统上式无法编译通过的,最后选择了版本1.2则很顺利的通过了。其下载地址可以点击。
下载完成后,我们在R的环境下运行:

setwd("下载包的目录")
install.packages("ROracle_1.2-1.zip",repos=NULL)
#install.packages("ROracle",type="source")

当然你也可以手动执行如下的操作:

R CMD INSTALL ROracle-1.2-1.zip

这样就完成了包的安装,最后通过类似如下的方式进行操作

library(ROracle)
drv <- dbDriver("Oracle")
con <- dbConnect(drv, "mesprd", "wip24ux")

最后关于这3个库的性能问题,可以参考。其执行速度关系为ROracle>RODBC>RJDBC。

参考文章:

https://docs.oracle.com/en/da...
https://cran.r-project.org/we...
https://stackoverflow.com/que...
https://stackoverflow.com/que...
https://stackoverflow.com/que...