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如何高效地遍历 MongoDB 超大集合?

王晗 / 3273人阅读

摘要:执行测试代码两种不同遍历方法的代码分别位于和。参考如何使用对一个万的的表进行遍历操作关于专注于微信小程序微信小游戏支付宝小程序和线上应用实时监控。自从年双十一正式上线,累计处理了亿错误事件,付费客户有金山软件百姓网等众多品牌企业。

GitHub 仓库:Fundebug/loop-mongodb-big-collection

本文使用的编程语言是 Node.js,连接 MongoDB 的模块用的是mongoose。但是,本文介绍的方法适用于其他编程语言及其对应的 MongoDB 模块。

错误方法:find()

也许,在遍历 MongoDB 集合时,我们会这样写:

const Promise = require("bluebird");

function findAllMembers() {
    return Member.find();
}

async function test() {
    const members = await findAllMembers();
    let N = 0;
    await Promise.mapSeries(members, member => {
        N++;
        console.log(`name of the ${N}th member: ${member.name}`);
    });
    console.log(`loop all ${N} members success`);
}

test();

注意,我们使用的是 Bluebird 的mapSeries而非map,members 数组中的元素是一个一个处理的。这样就够了吗?

当 Member 集合中的 document 不多时,比如只有 1000 个时,那确实没有问题。但是当 Member 集合中有 1000 万个 document 时,会发生什么呢?如下:

<--- Last few GCs --->
rt of marking 1770 ms) (average mu = 0.168, current mu = 0.025) finalize [5887:0x43127d0]    33672 ms: Mark-sweep 1398.3 (1425.2) -> 1398.0 (1425.7) MB, 1772.0 / 0.0 ms  (+ 0.1 ms in 12 steps since start of marking, biggest step 0.0 ms, walltime since start of marking 1775 ms) (average mu = 0.088, current mu = 0.002) finalize [5887:0x43127d0]    35172 ms: Mark-sweep 1398.5 (1425.7) -> 1398.4 (1428.7) MB, 1496.7 / 0.0 ms  (average mu = 0.049, current mu = 0.002) allocation failure scavenge might not succeed


<--- JS stacktrace --->

FATAL ERROR: Ineffective mark-compacts near heap limit Allocation failed - JavaScript heap out of memory
 1: 0x8c02c0 node::Abort() [node]
 2: 0x8c030c  [node]
 3: 0xad15de v8::Utils::ReportOOMFailure(v8::internal::Isolate*, char const*, bool) [node]
 4: 0xad1814 v8::internal::V8::FatalProcessOutOfMemory(v8::internal::Isolate*, char const*, bool) [node]
 5: 0xebe752  [node]
 6: 0xebe858 v8::internal::Heap::CheckIneffectiveMarkCompact(unsigned long, double) [node]
 7: 0xeca982 v8::internal::Heap::PerformGarbageCollection(v8::internal::GarbageCollector, v8::GCCallbackFlags) [node]
 8: 0xecb2b4 v8::internal::Heap::CollectGarbage(v8::internal::AllocationSpace, v8::internal::GarbageCollectionReason, v8::GCCallbackFlags) [node]
 9: 0xecba8a v8::internal::Heap::FinalizeIncrementalMarkingIfComplete(v8::internal::GarbageCollectionReason) [node]
10: 0xecf1b7 v8::internal::IncrementalMarkingJob::Task::RunInternal() [node]
11: 0xbc1796 v8::internal::CancelableTask::Run() [node]
12: 0x935018 node::PerIsolatePlatformData::FlushForegroundTasksInternal() [node]
13: 0x9fccff  [node]
14: 0xa0dbd8  [node]
15: 0x9fd63b uv_run [node]
16: 0x8ca6c5 node::Start(v8::Isolate*, node::IsolateData*, int, char const* const*, int, char const* const*) [node]
17: 0x8c945f node::Start(int, char**) [node]
18: 0x7f84b6263f45 __libc_start_main [/lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6]
19: 0x885c55  [node]
Aborted (core dumped)

可知,内存不足了。

打印find()返回的 members 数组可知,集合中所有元素都返回了,哪个数组放得下 1000 万个 Object?

正确方法:find().cursor()与 eachAsync()

将整个集合 find()全部返回,这种操作应该避免,正确的方法应该是这样的:

function findAllMembersCursor() {
    return Member.find().cursor();
}

async function test() {
    const membersCursor = await findAllMembersCursor();
    let N = 0;
    await membersCursor.eachAsync(member => {
        N++;
        console.log(`name of the ${N}th member: ${member.name}`);
    });
    console.log(`loop all ${N} members success`);
}

test();

使用cursor()方法返回 QueryCursor,然后再使用eachAsync()就可以遍历整个集合了,而且不用担心内存不够。

QueryCursor是什么呢?不妨看一下 mongoose 文档:

A QueryCursor is a concurrency primitive for processing query results one document at a time. A QueryCursor fulfills the Node.js streams3 API, in addition to several other mechanisms for loading documents from MongoDB one at a time.

总之,QueryCursor 可以每次从 MongoDB 中取一个 document,这样显然极大地减少了内存使用。

如何测试?

这篇博客介绍的内容很简单,但是也很容易被忽视。如果大家测试一下,印象会更加深刻一些。

测试代码很简单,大家可以查看Fundebug/loop-mongodb-big-collection。

我的测试环境是这样的:

ubuntu 14.04

mongodb 3.2

nodejs 10.9.0

1. 使用 Docker 运行 MongoDB

sudo docker run --net=host -d --name mongodb daocloud.io/library/mongo:3.2

2. 使用mgodatagen生成测试数据

使用 mgodatagen,1000 万个 document 可以在 1 分多钟生成!

下载 mgodatagen:https://github.com/feliixx/mgodatagen/releases/download/0.7.3/mgodatagen_linux_x86_64.tar.gz

解压之后,复制到/usr/local/bin 目录即可:

sudo mv mgodatagen /usr/local/bin

mgodatagen 的配置文件mgodatagen-config.json如下:

[
    {
        "database": "test",
        "collection": "members",
        "count": 10000000,
        "content": {
            "name": {
                "type": "string",
                "minLength": 2,
                "maxLength": 8
            },
            "city": {
                "type": "string",
                "minLength": 2,
                "maxLength": 8
            },
            "country": {
                "type": "string",
                "minLength": 2,
                "maxLength": 8
            },
            "company": {
                "type": "string",
                "minLength": 2,
                "maxLength": 8
            },
            "email": {
                "type": "string",
                "minLength": 2,
                "maxLength": 8
            }
        }
    }
]

执行mgodatagen -f mgodatagen-config.json命令,即可生成 10000 万测试数据。

mgodatagen -f mgodatagen-config.json
Connecting to mongodb://127.0.0.1:27017
MongoDB server version 3.2.13

collection members: done            [====================================================================] 100%

+------------+----------+-----------------+----------------+
| COLLECTION |  COUNT   | AVG OBJECT SIZE |    INDEXES     |
+------------+----------+-----------------+----------------+
| members    | 10000000 |             108 | _id_  95368 kB |
+------------+----------+-----------------+----------------+

run finished in 1m12.82s

查看 MongoDB,可知新生成的数据有 0.69GB,其实很小,但是使用 find()方法遍历会报错。

show dbs
local  0.000GB
test   0.690GB

3. 执行测试代码

两种不同遍历方法的代码分别位于test1.js和test2.js。

参考

如何使用 mongoose 对一个 100 万+的 mongodb 的表进行遍历操作

Cursors in Mongoose 4.5

关于Fundebug

Fundebug专注于JavaScript、微信小程序、微信小游戏、支付宝小程序、React Native、Node.js和Java线上应用实时BUG监控。 自从2016年双十一正式上线,Fundebug累计处理了10亿+错误事件,付费客户有Google、360、金山软件、百姓网等众多品牌企业。欢迎大家免费试用!

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转载时请注明作者Fundebug以及本文地址:
https://blog.fundebug.com/2019/03/21/how-to-visit-all-documents-in-a-big-collection-of-mongodb/

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